CLERO REGULAR

El clero regular desempeño una labor destacada. Se hizo cargo del adoctrinamiento y conversión de los indígenas; posteriormente, guió la educación de los españoles nacidos en América.
En nueva Galicia el conquistador se enfrentó a un problema todavía más grave: la comunicación, pues aquí, como en el resto de Mesoamérica, se hablaban un sinnúmero de lenguas. El español, en un intento de establecer comunicación pero ante la imposibilidad de hacerlo, optó por solo aprender y enseñar el náhuatl. De las órdenes religiosas, fueron los franciscanos.
Los religiosos en su mayoría eran los más ignorantes y, por tanto, los mas incapaces para difundir la lengua castellana.
A la nueva Galicia arribaron varias órdenes religiosas, además de la de los franciscanos, en el norte continuaron la labor evangelizadora iniciada por los jesuitas.
Los jesuitas se instalaron en Guadalajara hacia fines de 1586, desde su primer momento lograron monopolizar la educación, el colegio que ellos fundaron y que llevo por nombre Santo Tomás.
Su influencia se sintió en Zacatecas, donde, al igual que en Guadalajara, monopolizaron las tarea educativas.
Los agustinos enfrentaron múltiples problemas para su establecimiento en Guadalajara. El mayor de ellos lo tuvieron con el obispo Pedro Ayala, quien los repudió siempre. Por su parte, los dominicos obtuvieron un permiso para establecerse en Guadalajara desde 1585, aunque arribaron hasta 1603, cuando lograron la venia de la Audiencia.
Los franciscanos se les buscaban por su caridad sin par, y a los jesuitas por su conocimiento en la ciencia.